Hoàng hậu Shōshi sinh hạ cho Thiên hoàng Ichijou hai đứa con trai vào năm 1008 và 1009. Những lần sinh nở của bà được mô tả chi tiết trong Nhật ký của Murasaki. Các vị Hoàng tử được sinh ra tại thành Tsuchimikado của ông nội, còn các linh mục Phật giáo thì chứng kiến các nghi thức.[9][11] Khi sinh người con trai thứ hai là Thân vương Atsuhira, Hoàng hậu Shōshi đã phải trải qua lần sinh nở khó khăn; cho rằng đó là do những linh hồn xấu xa gây ra, bà đã thực hiện nghi thức xuống tóc, mặc dù chỉ có một lọn tóc của bà được cắt.[12] Nghi thức này được coi là một lễ xuất gia nhỏ, hay nghi thức khai tâm Phật giáo, với mục đích nhận được sự bảo vệ của thần linh đối với bà và con trai khỏi nguy hiểm.[6]

Nghi lễ được thực hiện vào những ngày cụ thể sau khi sinh. Sau đó, Michinaga đã đến thăm Shōshi với một nghi lễ xa hoa vào 16 ngày sau khi bà sinh con.[11] Trong nhật ký của mình, sĩ nữ Murasaki đã mô tả quần áo của một người phụ nữ tham dự nghi thức, với "lớp vỏ áo của bà ta có năm còng trắng lót bằng đỏ sẫm, và áo choàng màu đỏ thẫm của bà được làm bằng lụa".[13] Vào ngày thứ 50 sau khi sinh, một buổi lễ được tổ chức, trong đó vị Thân vương mới sinh được dâng lên một miếng mochi; Michinaga đã thực hiện nghi thức dâng bánh gạo cho cháu trai Atsuhira. Trong nhật ký của mình, Murasaki đã mô tả sự kiện mà có lẽ bà đã tham dự.[14]

Nhờ vào ảnh hưởng của ông ngoại Michinaga,nên hai người con trai của Hoàng hậu Shōshi có cơ hội trở thành người thừa kế ngai vàng hơn là con của Hoàng hậu Teishi, đặc biệt là sau khi Teishi qua đời vào năm 1001.[3] Khi Thiên hoàng Ichijou thoái vị vào năm 1011 và băng hà ngay sau đó,[15] trưởng tử của Hoàng hậu Shōshi đã được sắc phong làm Hoàng Thái tử, về sau ông lên ngôi, trở thành Thiên hoàng Go-Ichijō.[3] Vào thời điểm đó, Hoàng hậu Shōshi đã dời đến tư dinh gia tộc Fujiwara ở gần hồ Biwa; bà cũng được cho là đã đem theo vị nữ quan thân cận của mình là Murasaki.[16] Vào năm 1016, Michinaga tiến cung con gái Kenshi cho Thiên hoàng Sanjō, và cũng buộc Thiên hoàng phải phế ngôi Thái tử đang vốn dĩ thuộc về Thân vương Atsuakira, con trưởng của ông. Cuối cùng, con trai thứ hai của Shōshi đã được phong làm Hoàng Thái tử kế nhiệm vào năm 1017, về sau ông lên ngôi, trở thành Thiên hoàng Go-Suzaku. Nhờ có hai người con trai lần lượt trở thành Thiên hoàng và Hoàng Thái tử, vị trí của Shōshi đã được bảo toàn và bà đã gây dựng được tầm ảnh hưởng mạnh mẽ cho mình trong Triều đình.[4]

Trong nhiều năm sau đó, quyền lực của Shōshi được lan rộng sang ngoại thích và bằng hữu, giúp họ trở thành những người nắm giữ chức vị cao trong Triều đình. Những vị cung phi tiến cung cho Thiên hoàng mà bà chọn lựa đều thuộc về hậu duệ trực tiếp của cha bà, nhờ đó bà đã khẳng định được quyền kiểm soát dòng dõi của cha mình trong nhiều năm.[15]